Für eine erfolgreiche PCR ist ein optimales Puffersystem notwendig. VWR® Taq DNA Polymerase Kits enthalten generell zwei verschiedene Puffer, einen Haupt- und einen Zusatzpuffer, die sich für unterschiedliche PCR-Anforderungen eignen. Alle Puffer enthalten Tris und 15 mM MgCl₂ (1,5 mM MgCl₂ Endkonzentration). Für eine einfache Optimierung ist zudem MgCl₂ in einem separaten Röhrchen enthalten.
Hauptpuffer: Der Hauptpuffer (NH4+) gibt ein unverfälschtes Amplifikationssignal (hohe Ausbeute) ab und minimiert die Notwendigkeit der Optimierung der Mg2+-Konzentration oder der Annealingtemperatur in den meisten Primer-Template-Systemen.
Zusatzpuffer: Der Zusatzpuffer ist der herkömmliche Kaliumpuffer (K+). Der Zusatzpuffer begünstigt eine hohe Spezifizität. Es könnte eine vorsichtige Optimierung der Annealingtemperaturen des Primers und der Mg2+-Konzentrationen erforderlich sein.
Kombinationspuffer: Ein Kombinationspuffer ist ein proprietäres Gemisch aus K+ und NH4+. Er kombiniert hohe Spezifizität mit einer guten Produktausbeute und einer hohen Toleranz für die Optimierung der Annealingtemperaturen des Primers und der Mg2+-Konzentrationen aufgrund der ausgewogenen Ammonium-Kalium-Formulierung.
Puffer für GC-reiche Templates: In Kombination mit VWR® TEMPase unterstützen GC-Puffer ausgezeichnete Amplifikationsergebnisse, die verschiedene GC-Gehalte anvisieren. Dies bestätigt, dass die Wahl des Puffers für eine erfolgreiche Amplifikation ausschlaggebend ist.